Zespół Szkół Katolickich w Nowym Sączu zapoczątkował działalność powołaniem Społecznego Katolickiego Liceum ogólnokształcącego w 1993 roku z inicjatywy Tadeusza Ramsa, pierwszego dyrektora oraz nauczyciela w nowo powstałej placówce. Była to pierwsza tego gatunku szkoła w diecezji tarnowskiej, która ma na celu połączenie skutecznej oraz praktycznej edukacji z wychowaniem młodzieży w duchu pobożności, szacunku do tradycji oraz Kościoła Katolickiego. Od 2000 roku patronem zespołu szkół jest błogosławiony Piotr Jerzy Frassati, którego beatyfikował św. Jan Paweł II. Liceum ma status szkoły niepublicznej, lecz dającej absolwentom te same uprawnienia co szkoła publiczna. ZSK zapewnia indywidualne nastawienie do każdego ucznia, a także możliwości rozwijania przez niego swoich pasji oraz uzdolnień, zwłaszcza w doskonale rozwiniętej sekcji artystycznej.
Przez multum lat w Zespole Szkół Katolickich działało również Gimnazjum, które zakończyło swoją działalność od roku szkolnego 2018/2019 z uwagi na zmiany w systemie szkolnictwa. Ciekawymi składnikami szkoły są przeciwnie zaś niezbicie unikalne Ogólnokształcąca Szkoła Sztuk Pięknych a oprócz tego Ogólnokształcąca Szkoła muzyczna II stopnia, które pozwalają połączyć naukę w gimnazjum oraz liceum w jednej placówce wystawiającej państwowe świadectwa.
Uczniowie tych szkół mają multum przedmiotów artystycznych, teraz propozycja skierowana jest do utalentowanych w zakresie muzyki oraz innych sztuk pięknych. W ramach dopełniania artystycznej oferty edukacyjnej w ramach zespołu szkół istnieje również Katolickie Liceum Plastyczne dla w głównej mierze utalentowanych w kierunku malarstwa, rysunku oraz wszelkich form pokrewnych.